Về phương hướng nhiệm vụ 6 tháng cuối năm 2016, Tổng Thanh tra Chính phủ yêu cầu, Vụ III rút kinh nghiệm những cuộc thanh tra đã thực hiện trong thời gian qua để làm tốt các cuộc thanh tra trong thời gian tới. Cụ thể, nên tiến hành đề xuất thanh tra ngay từ bước đầu, nhất là giai đoạn đấu thầu (chọn giai đoạn thanh tra cho thích hợp) nhằm hạn chế sai phạm, thất thoát tiền, tài sản Nhà nước. Chịu trách nhiệm trong thực hiện nhiệm vụ, chánh đổ lỗi loanh quanh theo đó, cán bộ phải đạt yêu cầu cao về mặt chuyên môn cũng như đạo đức công vụ. Nêu cao tinh thần đoàn kết, nhất trí, giảm đi cái tôi cá nhân để tạo nên sức mạnh tập thể, hỗ trợ nhau phát triển, vượt qua mọi khó khăn để hoàn thành nhiệm vụ, nâng cao dân chủ, trên nguyên tắc tập trung. Về cuộc thanh tra 02 trường Đại học, Tổng Thanh tra Chính phủ đề nghị, Vụ III tiến hành kiểm tra, xác minh nắm tình hình chính xác để tiến hành thanh tra, khi thanh tra cần quan tâm tới vấn đề tự chủ về tài chính và tự chủ về nhân lực để đưa ra đề xuất, kiến nghị trúng với yêu cầu thực tiễn đặt ra hiện nay trong vấn đề tự chủ, tự chịu trách nhiệm của một số đơn vị sự nghiệp công lập./.