Trên cơ sở kết luận thanh tra, Thanh tra Chính phủ kiến nghị Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo Bộ GTVT kiểm điểm để xử lý trách nhiệm tập thể, cá nhân lãnh đạo Bộ GTVT có liên quan trong việc để xảy ra các tồn tại, hạn chế, khuyết điểm, vi phạm trong việc tái cơ cấu doanh nghiệp Nhà nước (sắp xếp lại, cổ phần hóa doanh nghiệp Nhà nước, doanh nghiệp cổ phần hóa sang kinh doanh đất, xây dựng nhà ở giai đoạn 2011 - 2021).

Chỉ đạo Ủy ban Quản lý vốn nhà nước xử lý trách nhiệm tập thể, cá nhân lãnh đạo Ủy ban Quản lý vốn nhà nước tại doanh nghiệp có liên quan để xảy ra các tồn tại, hạn chế, khuyết điểm, vi phạm trong việc chậm quyết toán VIMC, ACV; trong việc chậm tham mưu đối với các cấp có thẩm quyền để Bệnh viện GTVT sau khi có phần hóa hoạt động chậm trong thời gian dài.

Chỉ đạo UBND các tỉnh, thành phố Hà Nội, thành phố Hồ Chí Minh, Đà Nẵng, Thừa Thiên Huế, Khánh Hòa, Thanh Hóa, Nghệ An, kiểm điểm để xử lý trách nhiệm tập thể, cá nhân có liên quan thuộc lãnh đạo các UBND các tỉnh, thành phố để xảy  ra các toonf tại, hạn chế, khuyết điểm, vi phạm trong việc cho ý kiến đối với phương án sử dụng đất của các doanh nghiệp khi cổ phần hóa…

Phát biểu tại buổi làm việc, đại diện Bộ Giao thông vận tải, UBND TP Hà Nội, UBND thành phố Hồ Chí Minh cùng các đơn vị được thanh tra cho biết xin tiếp thu toàn bộ nội dung kết luận của Thanh tra Chính phủ và sẽ báo cáo lãnh đạo chỉ đạo các đơn vị nghiêm túc thực hiện các nội dung kiến nghị của Thanh tra Chính phủ tại kết luận thanh tra. Đồng thời mong muốn tiếp tục nhận được sự quan tâm giúp đỡ của Thanh tra Chính phủ trong thời gian tới.

Tại buổi công bố kết luận thanh tra, ông Nguyễn Mạnh Cường, Phó Cục trưởng Cục Giám sát, Thẩm định và Xử lý sau thanh tra, Thanh tra Chính phủ cho biết đây là kết luận thanh tra có phạm vi rộng, nhiều nội dung, đề nghị Bộ GTVT, UBND thành phố Hà Nội, UBND thành phố Hồ Chí Minh và các đơn vị được thanh tra xây dựng kế hoạch thực hiện cụ thể đối với các kiến nghị tại kết luận thanh tra đảm bảo thời gian theo quy định.

Kết luận tại buổi công bố kết luận thanh tra, ông Hoàng Hưng, Vụ trưởng Vụ I cho biết, việc công bố Kết luận thanh tra thực hiện theo quy định của pháp luật. Trên cơ sở kết luận thanh tra, đề nghị các đơn vị có kế hoạch để chỉ đạo, phối hợp với các đơn vị triển khai thực hiện các kiến nghị theo kết luận thanh tra. Trong quá trình triển khai thực hiện kết luận thanh tra, nếu có vướng mắc, các đơn vị trao đổi với Cục Giám sát Thẩm định và Xử lý sau thanh tra, Thanh tra Chính phủ để tổ chức thực hiện Kết luận thanh tra có hiệu quả.